Im August 2009 wurde er zum Richter am Oberlandesgericht ernannt.
Von Oktober 2009 bis Juni 2014 war er am Oberlandesgericht Düsseldorf tätig, wo er mit dem überwiegenden Teil seiner Arbeitskraft mit Verwaltungsaufgaben betraut war, zunächst als Leiter des mit IT-Angelegenheiten befassten Dezernats und später als Leiter des für Organisation, Kosten- und Kassenwesen zuständigen Dezernats.
Ab Juni 2014 war Dr. Wemeckes Vizepräsident des Landgerichts Kleve, bevor er im Oktober 2021 zum Vizepräsidenten des Landgerichts Düsseldorf ernannt wurde.
Neben seinen Aufgaben in der dortigen Gerichtsverwaltung war er zuletzt Vorsitzender einer erstinstanzlichen Zivilkammer.
Dr. Bernd Wermeckes ist verheiratet und Vater von zwei erwachsenen Söhnen.